La diferencia en los skills es mínima, la diferencia más grande aparentemente (no me consta) está en la cantidad y calidad de bosses de un lado y del otro. Dicen algunos que los Elyos tienen ventaja en ese asunto, entonces se pueden equipar mejor y más rápido. Pero de nuevo, no me consta ya que jugué relativamente poco al juego, y casi siempre del lado de los Elyos (por preferencia personal, no por esta ventaja teórica).