Mira, eso depende de los conocimientos que tengas vos y los precios que se manejen donde vivas. El cooler se puede cambiar, generalmente va soldado a la placa de la fuente o con un conector. En cualquiera de los dos casos podes cortar los cables (si no sabes soldar o no tenes conector) y listo. Pero la fuente es algo peligroso ya que trabaja con altos voltajes y no es conveniente que cualquiera le meta mano. Un cooler aca sale 5 dol y una fuente 20. de 500w mas o menos. Asi que vos lo manejas.

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A tener en cuenta:

No se trata solo de que porque ves que no gira el ventilador, se puede concluir que ese es el problema. O sea, tenes que saber bien que es lo que esta mal y despues ver si no te conviene cambiar la fuente. Pueden pasar muchas cosas. Por ejemplo:

- El cooler no gira, por lo tanto los disipadores no enfrian los trans y te tira tensiones que estan por fuera de lo normal.
en ese caso tenes que ver si te sucede enseguida, o al rato. Si sucede enseguida (la fuente no llego a levantar temperatura) y ya te tira errores o se cuelga es porque ya se te estropeo la fuente al funcionar por un periodo largo sin enfriar. Ahi no lo solucionas cambiando el cooler porque los componentes de la fuente se estropearon por el calor.
- Ahora si te sucede al rato, significa que es cuando levanta temperatura (por no girar el cooler) entonces ahi se podría suponer que la fuente funciona correctamente y comienza a fallar al rato por no refrigerar sus componentes. En ese caso podrías asumir que solo con cambiar el cooler se arregla.

Todo esto suponiendo que te diste cuenta a tiempo y el problema no paso de la fuente. Porque si entrego tensiones fuera de lo tolerado por la mother y demas componentes podes tener mal parte del hardware ademas de la fuente. Tambien te darias cuenta si cambiaras la fuente y continuara tirando errores. Lo primero es saber si arranca mal en frio, o comienzan los problamas al rato. Si es al rato de funcionar, pienso que cambiando el cooler solucionas todo. Ojo si metes mano,
SIEMPRE DESCONECTAR LA ALIMENTACIÓN A LA RED ELECTRICA!!
cualquier cosa a las ordenes. Y espero que no te haya mariado mucho. Suerte.