El problema es que cuando haces una instalacion de 0 de windows te queda el registro pelado, y los programas que nombras guardan claves de registros con varios parametros para cuando se ejecutan que son indispensables.
Lo que yo haria es una vez que tenes todo instalado joya hacer una imagen del disco del sistema operativo y guardarlo, cuando se te joda la instalacion copias la imagen y listo.