Hardware

Aca te van a empezar a decir pelotudeces, anda ahi que los que te contesten van a hacerlo con la intencion de dar una mano.

Microcortes a nivel fisico pueden ser principalmente por:

Filtros, calidad de la conexion interna, calidad del cableado externo del ISP.

Despues por soft:

Algun bicho en el SO, configuraciones de red mal hechas, configuracion del router.

Primero tírate un netstat -b en la consola, es lo mas basico para empezar y ver que ejecutables están usando tu conexión.

BTW: Presta atención si pasa en un momento especifico (por ej. te llaman por telefono) o cada un lapso de tiempo regular.

Si empezo de forma subita lo mas probable es que tengas algun bichito o sea el ISP.

PD: Que tipo de conexión es la de tu ISP?