No se bien como funciona la electronica en minecraft, pero se que existen los inverters, son circuitos que invierten la señal, osea si les llega señal no devuelven nda, y si no les llega nada devuelven señal, podes poner una palanca/boton con los cables que vallan a 2 puertas, pero entre la palanca y una de las puertas metes un inverter. Eso deberia funcionar. De ultima hackeate todo el cliente para tener banda de materiales y experimentas en singleplayer.

Si me queda algun tiempo esta tarde pruebo, sino esta noche.

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PD: otra forma mas facil seria que hagas lo mismo pero sin el inverter. Pones las 2 puertas con el mismo boton pero antes de tocar el boton abris a mano una de las 2, cosa de que inicialmente una este abierta y la otra cerrada, creo que cuando toques el boton van a invertir la posicion. Creo.