No, no es problema de las quest (creo yo, con mi limitado conocimiento). Me parece que es, que el save al server de quest llega inmediatamente, mientras que el save del pj no. Entonces, si hay rollback, se pierden la exp, los items, la rep, pero el servidor tiene como que las quest las completaste. A mi me paso muchas veces ya ¬¬ Pero bueno, ajo y agua.
Otra gran consecuencia de esto, es cuando una quest te da una recipe, o un skill, que no se guarda, me paso tambien XD Por ahora nada grave. Tratando de buscar soluciones o prevenciones a esto, probe un par de veces tirar .save de vez en cuando, pero solo una vez me parecio que anduvo, en el sentido de que lo tire cuando empezo a salir lag, y cuando volvio no habia perdido nada. Habria que preguntar si esto sirve o no.