Dos posibilidades respecto a lo que pasará en el anime respecto al manga:
1- Bajan el ritmo hasta abarcar 1 capítulo del manga en anime. Ya lo hicieron con OP y es una mierda, aviso. xd
2- *Spoilers del manga*
Que corten el anime cuando Gon se encuentra con Gin, ahí arriba en el árbol.

Se podría ver como que el anime fue un método de marketing para "hypear" el manga y que tenga un arranque fuerte. El tema sería si después volverán a reanudar el anime, tipo como hicieron con Fairy Tail; o si lo darán como terminado el anime.

Todo dependerá del éxito tanto del anime como del manga.