Si el cooler no te hace mucho ruido, entonces lo mejor es que lo sigas dejando laburar en seco (con el lubricante que vino de fábrica); porque al aceite que vos le agregues se le impregna mucho más fácil el polvo y a la larga es peor; así que proba de limpiarlo con un pincel de cerda blanda (de los buenos, esos que no pierden pelos).

Pero llega un momento en que vas a tener que agregarle algún lubricante porque empieza a hacer mucho ruido (empezás a sentir como que raspa, que no gira bien bien)... entonces, cuando veas que ya el ruido se siente, primero lo limpiás obvio, y después le ponés aceite de máquina de coser o aceite de silicona.

Si cuando sacás el cooler ves que ya tuvo aceite en algún momento, entonces tirale un poquito de wd40 o similar para limpiar el aceite viejo, limpialo bien y recién después ponele el nuevo.

En cuanto a los cambios de rpms, como ya te dijeron es normal.